De FusionPlex ALL kit van de firma Archer kan fusietranscripten opsporen van de meest frequente fusietranscripten die bij ALL patiënten aanwezig zijn. Meer specifiek kunnen fusies van de volgende genen gedetecteerd worden: ABL1, ABL2, BCL11B, BCL2, BCL6, BCR, CHD1, CRLF2, CSF1R, EBF1, EPOR, ETV6, FGFR1, IKZF1, IKZF2, IKZF3, JAK2, KLF2, KMT2A, MLLT4, MYC, NF1, NOTCH1, NTRK3, NUP214, NUP98, P2RY8, pAX5, PBX1, PDCD1LG2, PDGFRA, PDGRFB, PICALM, PTK2B, RUNX1, SEMA6A, SETD2, STIL, TAL1, TCF3, TYK2 en ZCCHC7.

Technische uitvoering:
Na RNA extractie wordt dit geconverteerd naar cDNA. Vervolgens worden hieraan adapters geligeerd met patiënt-specifieke barcodes en de nodige adapters die sequencing op de MiSeq van Illumina toelaten. Vervolgens worden de fusietranscripten geamplificeerd met gebruik van een gen-specifieke primer en een universele primer, die bindt met de adapter. Na sequentie-bepaling worden de bekomen sequenties geanalyseerd met de Archer Analysis Software. 
De library preparation, sequenering, primaire en secundaire data-analyse wordt uitgevoerd door het platform Moleculaire Diagnostiek UZ Gent (MDG) (https://www.cmgg.be/nl/zorgverlener/labguide/platform-moleculaire-diagnostiek-uz-gent-mdg).

De RNAseq analyse kan zowel gekende fusietranscripten (zoals bv. ETV6-RUNX1 of STIL-TAL) als nieuwe fusietranscripten (waarvan één van de partners onderzocht wordt met dit panel) identificeren. 
Deze analyse wordt enkel uitgevoerd in het kader van ALL diagnose.

Belang pre-analytische fase - stabiliteit staal: 
De stabiliteit van een staal met vermoeden acute leukemie voor moleculaire uitwerking is beperkt daar de bepaling op RNA gebeurt. Op die manier moet de verwerking van het monster (isolatie witte bloedcellen) zeker binnen de 48h na afname uitgevoerd worden! Het staal daarom zo snel mogelijk naar het labo Moleculaire Diagnostiek (MolHem) versturen, namelijk binnen de 24h na afname! In tussentijd moet het staal in de koelkast bewaard worden (2-8°C). 

Terugbetaling:
Het opsporen van verworven chromosoom of genafwijkingen (met uitsluiting van Ig en TCR genherschkkingen) door middel van een moleculair biologische methode in de diagnostische investigatiefase van een acute lymfoblastische leukemie (ALL) kan 5x aangerekend worden. Gezien het uitgebreid sceenen (28 fusiegenen) is deze analyse volledig terugbetaald (RIZIV nr 588431-588442, 5x B3000). Ook een herval (> 1 jaar later) kan terug volledig uitgewerkt worden.