De Hemavision multiplex qPCR kit (DNA Technology) is gevalideerd voor kwalitatieve detectie van translocaties bij de diagnose van acute leukemieën en detecteert 28 genherschikkingen, of 145 breekpunt en splice varianten.
De meest frequente fusietranscripten bij acute leukemie die opgespoord worden zijn:
RUNX1-RUNX1T1/AML1-ETO of t(8;21), CBFB-MYH11 of inv(16), PML-RARA of t(15;17), DEK-NUP214/DEK-CAN of t(6;9), BCR-ABL1 of t(9;22), ETV-RUNX/TEL-AML of t(12;21), TCF3-PBX1/E2A-PBX1 of t(1;19), SIL-TAL of del(1p33) en verschillende MLL (11q23) herschikkingen (fusiepartners AF1p, AF1q, AF1X, AF4, AF6, AF9, AF10, AF17, AF19, ELL, ENL).
Daarnaast worden de meer zeldzame translocaties ook opgespoord: t(1;19), t(17;19), t(3;21), t(16;21), t(9;9), t(11;17), t(5;17), t(3;5), t(9;12), t(5;12)en t(12;22).
BELANGRIJK: t(1;22)(p13;q13) of OTT-MAL (RBM15-MKL1) zit niet in deze screeningsassay. Deze PCR test wordt bij een cytomorfolgisch en/of flowcytometrisch vermoeden van een megakaryoblasten leukemie (AML-M7) bijkomend ingezet (zie extra info bij deze test).
Deze (q)PCR wordt slechts uitzonderlijk gebruikt voor kwalitatieve detectie van translocaties bij follow-up van zeer zeldzame translocaties in leukemieen (MRD analyse). Deze laatste toepassing is niet gevalideerd (gevoeligheid niet gekend).
Analytische gevoeligheid of detectielimiet van deze assay:
De exacte gevoeligheid is ongekend maar voldoende om 1 abnormale cel op 100 normale cellen te detecteren (diagnostisch). Gezien dat er gebruik wordt gemaakt van een qPCR kunnen we ervan uitgaan dat de detectielimiet zeker 10E-4 is.
|