Mutatie JAK2 exon 12/14
Afdeling: Moleculaire Diagnostiek: Hematologie
Pathologie: Myeloproliferatieve aandoeningenAanvraagformulier: Aanvraagformulier bijzondere hematologie - cytomorfologie | immunofenotypering | moleculaire analyses
Staaltype:
Bloed/beemerg EDTA
Volume:
1 EDTA tube bloed (min. 1 mL) of beenmerg (min. 1 mL)
Uitvoering:
Wekelijks
Antwoordtijd:
Max. 25 dagen
Afnamecondities:
Vers afgenomen met vermelding afnametijdstip op aanvraagformulier (datum en uur)
Verzending:
Binnen de 2 dagen na afname
Methode:
Next Generation Sequencing (NGS)
Techinfo:
Om te screenen naar mutaties in exon 12 en 14 van JAK2 gen, wordt gebruikt gemaakt van of next generation sequencing (NGS) m.b.v. van een panel met een beperkt aantal genen (MPNmini panel). Technische informatie: - Mutatieanalyse gebaseerd op massive parallel sequencing of next generation sequencing (NGS); voor volledig panel (3 genen) zie informatie bij `Mutatieanalyse van genen betrokken bij MPN mbv NGS` - Enkel varianten met een VAF (Variant Allele Frequency) van > 5% met klinische relevantie worden gerapporteerd. - RefSeq (NCBI): NM_004972.3 - Exon 12 en 14 - Codon: alle codons - Nucleotiden: c.1514-1641 (exon 12) en c.1777-1864 (exon 14) - Coördinaten (chromosomale posities) van de nucleotiden van interesse (hg38): chr9:5069923-5070054 (exon 12) en chr9:5073696-5073787 (exon 14) Uitvoering: De library preparation, sequenering, primaire en secundaire data-analyse wordt uitgevoerd door het platform Moleculaire Diagnostiek UZ Gent (MDG) (https://www.cmgg.be/nl/zorgverlener/labguide/platform-moleculaire-diagnostiek-uz-gent-mdg)
Klinische info:
In 2005 toonden verschillende groepen een frequente mutatie in JAK2 (Janus Kinase 2) aan bij patiënten met de ziekte van Vaquez (PV), essentiële trombocytose (ET) of primaire myelofibrose (PMF). De meest frequente mutatie c.1849G>T in exon 14 (p.(Val617Phe)) komt voor bij zo goed als alle patiënten met PV, bij 65 % van patiënten met ET en bij 55 % van de patiënten met PMF. Mutaties in JAK2 exon 12 worden in ~5% van patiënten met de ziekte van Vaquez gevonden. Daarnaast kunnen ook andere missense mutaties (andere dan de meest voorkomende c.1849G>T (p.(Val617Phe)) mutatie) voorkomen in exon 14. Het aantonen van een JAK2 mutatie is een ondersteuning in de diagnostiek (major diagnostisch criterium WHO 2008).
Opmerkingen:
Belang pre-analytische fase - stabiliteit staal: Aparte, ongeopende EDTA buis voor moleculaire uitwerking. Het staal moet binnen de 2 dagen na afname verzenden worden naar labo Moleculaire Diagnostiek hematologie (MolHem) zodat dit binnen de 3 dagen na afname in het labo kan verwerkt worden. In tussentijd moet het staal in de koelkast bewaard worden (2-8°C). Terugbetaling: Het opsporen van mutaties in JAK2 gen valt vanaf 1 november 2016 onder de RIZIV verstrekking 588512-588523, waarbij genafwijkingen door middel van een moleculair biologische methode worden opgespoord in de diagnostische investigatiefase van een chronische myeloproliferatieve neoplasie. Dit betekent dat binnen de diagnostiek van MPN, 2 testen (waaronder ook CALR en MPL mutaties) 1x per jaar kunnen worden aangerekend met een B-waarde van 3500 per test.
Externe kwaliteits evaluatie:
MODHEM netwerk (www.modhem.nl) / UK NEQAS (United Kingdom National External Quality Assessment Service) / Zelf georganiseerde externe kwaliteitscontrole
Accreditatie:
Ja (Accreditatie volgens BELAC-certificaat 087-MED)
Validatiedossier:
Ja
Gerelateerd:
Verantwoordelijke:
Apr. biol. B. Denys